Модуль хирургической стоматологии был образован решением ученого совета №1323 от 12.07.2011г. путем разделения кафедры хирургической стоматологии на 2 модуля.
Кафедра хирургической стоматологии была организована в 1962 году на базе курса челюстно-лицевой хирургии при кафедре госпитальной хирургии АГМИ. Заведующим кафедрой был назначен Евгений Феофанович Чернов.
Неоценим вклад Е.Ф. Чернова в подготовку научно-педагогоческих кадров для молодого факультета. Несмотря на короткую, но яркую плодотворную жизнь, Евгений Феофанович успел подготовить целую плеяду ученых-педагогов (Я.А.Раушенбах, Р.Г.Дмитриева, А.Н.Фокина, А.И.Химич, Л.Я.Зазулевская , Д.С.Сагатбаев, Т.К.Супиев, Г.Д.Мишина, К.Е.Рысдавлетов, В.В.Халитова, К.К.Куракбаев, Ш.Б.Камалов), многие из которых сейчас являются ведущими специалистами.
Организованная Е.Ф Черновым кафедра хирургической стоматологии по сей день является кузницей высококвалифицированных научно-педагогических кадров для стоматологии Казахстана. Здесь начинали свой творческий путь профессор Д.Л.Корытный, Т.К.Супиев, Л.Я.Зазулевская, Д.С.Сагатбаев, К.Т.Тулеуов, К.З.Шалабаева, В.П.Русанов, К.К.Куракбаев доценты: Т.У.Батыров, Ш.Б.Камалов, Б.А.Умбетьяров, Х.Л.Сагандыков, З.К.Курмангалиев, к.м.н. Р.Н.Жартыбаев.
В 1974-1980 годах кафедрой руководила к.м.н. доцент Мария Павловна Осколкова. Опытный клиницист, замечательный хирург М.П. Осколкова внесла большой вклад в подготовку челюстно-лицевых хирургов для республики.
С 1980 г. бессменным заведующим кафедрой являлся Жаксылык Бекбатырович Уразалин. Он успешно совмещал преподавательскую работу с ответственной должностью главного врача Республиканской стоматологической поликлиники и главного стоматолога МЗ Каз.ССР. Обладая организаторскими способностями Ж.Б. Уразалин уже в те годы сделал неоценимый вклад в развитие стоматологической службы стоматологического образования в Казахстане. Благодаря его усилиям стоматологическая поликлиника АГМИ получила статус Республиканской, оставаясь учебной базой для стоматологических кафедр АГМИ.
Жаксылык Бекбатырович принимал активное участие в жизни института (позже университета). С 1978 по 1984 годы Жаксылык Бекбатырович был деканом стоматологического факультета АГМИ, в 1989-1995 годах он занимает должность проректора по клинической работе, по НИР, а в 1995-2001 проректора по учебной работе.
Он принимал активное участие в организации специализированного Совета по защите докторских и кандидатских диссертаций и является бессменным председателем со дня основания. Организация Совета явилась важной вехой в развитии стоматологической науки в Казахстане. За эти годы защищены 8 докторских и свыше 70 кандидатских диссертаций.
С момента становления и особенно в 80-е годы кафедра хирургической стоматологии поддерживала тесные научные контакты с коллегами из Москвы, Ленинграда, Калинина, Минска и других городов бывшего СССР. Непосредственными учителями руководителями стоматологов-хирургов Казахстана стали яркие представители советской школы челюстно-лицевой хирургии, профессора, крупные ученные с мировым именем: А.И. Евдокимов, В.С. Дмитриева, А. А. Лимберг, Н.Н. Бажанов, Ю.И. Бернадский, И.И. Ермолаев, В.А. Козлов, В.М. Безруков, В.М. Соловьев, А.С. Григорян, В.В. Паникоровский. Их труд, их неоценимая помощь оказались не напрасными. Из 21 докторов медицинских наук по специальности стоматологии 9 являются челюстно-лицевыми хирургами. Это профессора Ж.Б. Уразалин, Т.К. Супиев, К.Т.Толеуов, Д.С. Сагатбаев, А.Г. Курашев, В.П. Русанов, А.Ж. Есимов, К.З. Шалабаева, К.К. Куракбаев. Они продолжают путь своих учителей, вносят посильный труд в развитие челюстно-лицевой хирургии и подготовку стоматологических кадров в РК.